Органами управления фонда являются совет фонда, правление фонда и исполнительный директор фонда.
Является высшим коллегиальным органом фонда. Назначение председателя и членов совета фонда, а также прекращение их полномочий осуществляются Президентом Российской Федерации.
Является коллегиальным исполнительным органом фонда. Назначение членов правления фонда, в том числе исполнительного директора, и прекращение их полномочий осуществляются советом фонда. Правление осуществляет текущее руководство деятельностью фонда, за исключением решения вопросов, отнесенных к компетенции совета фонда и исполнительного директора.
Является надзорным органом фонда. К компетенции попечительского совета относятся: осуществление надзора за деятельностью фонда и соблюдением им законодательства Российской Федерации, осуществление надзора за использованием средств фонда, надзор за принятием советом фонда, правлением фонда и исполнительным директором фонда решений и обеспечением их исполнения. Попечительский совет фонда осуществляет свою деятельность на общественных началах.
С 21 по 24 октября 2024 года в Институте археологии и этнографии Сибирского отделения Российской академии наук в Новосибирске работала всероссийская (с международным участием) научная конференция «Знаки и образы в искусстве каменного века», приуроченная к 300-летию Российской академии наук.
Выставка «Традиционная буддийская культура калмыков в исследованиях академических экспедиций. Из коллекции Астраханского музея-заповедника XIX — начала XX веков» создана в рамках одноимённого экспозиционно-выставочного проекта, который реализуется при поддержке фонда «История Отечества». Она приурочена к 300-летнему юбилею Российской академии наук.
25 ноября в конференц-зале Оренбургской областной библиотеки им. Н.К. Крупской в преддверии 250-летия со дня рождения выдающегося государственного деятеля, военного губернатора Оренбурга и Санкт-Петербурга Петра Кирилловича Эссена, состоялась двойная презентация проектов, реализованный оренбургском отделением РИО.
Федеральное архивное агентство, Российское Историческое Общество, Российский государственный архив социально-политической истории, при участии Государственного архива Российской Федерации, при поддержке фонда «История Отечества» представляют историко-документальную интернет-выставку к 100-летию образования СССР